Gon, enfant meurtri, est fondamentalement assoiffé de nature, de liberté, de reconnaissance. Aux abords de son adolescence, il apprend que son père est en vie et qu'il est un hunter (chasseur), parcourant l'univers à la recherche de trésors. Ce statut privilégié demande à avoir des compétences innées dans des domaines bien spécifiques pour braver des obstacles sans précédent.
Dans la quête du père inconnu, Gon se destine alors à devenir Hunter. Pour cela, il faut passer un examen d'une exigence rare où il y a très peu d'élus. C'est ainsi qu'il est amené à vivre une aventure merveilleuse avec trois nouveaux amis et une force intérieure décuplée. Gon, Kirua, Kurapika et Leolio font face ensemble à la difficulté des épreuves. Ils deviennent très vite solidaires et unis dans un seul objectif : être les meilleurs.