Dans le japon féodal, Inuyasha, être mi-démon mi-humain, n'a qu'une obsession, devenir un démon à part entière. Lors de ses tentatives pour s'emparer de la perle sacrée de Shikon, qui lui permettrait de réaliser son rêve, un sort lui est jeté et il se retrouve scellé à un arbre.
Cent cinquante ans plus tard, dans le Japon moderne, Kagome, une jeune fille qui s'apprête à fêter ses 15 ans, tombe dans un puits et se retrouve transportée à l'époque Sengoku où elle fait la connaissance d'InuYasha, qu'elle délivre de son sort. Il s'avère que Kagome, possède en elle la pierre de Shikon. Malheureusement, suite à des péripéties, la pierre se brise et les fragments s'éparpillent dans chaque coin du monde. InuYasha et Kagome doivent alors unir leur force afin de retrouver chaque morceau et reconstituer la perle de Shikon...